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开学季推荐,利用RePure-C开启PCR探索的新思路

时间:2020.06.12

RePure-C基因扩增仪,是柏恒科技产品面向“精准科研”的新作之一,特点是具备了二维梯度功能,即在一次实验中同时探索横向及纵向温度梯度,以期将PCR仪的温度探索功能做到最佳。
2020年4月1日,重庆医科大学公布了获得新冠病毒全人源单克隆抗体的最新研究,并对科研过程中使用的新型二维梯度PCR仪-RePure-C进行了展示。在本月初,RePure-C也陆续收到了来自日本、印度、泰国、中国台湾、浙江大学等各地用户的好评,在初步推向市场的几个月内反馈良好。


抗体基因提取、克隆与表达(图片来自重医官微)


二维梯度PCR,区别于传统的普通梯度PCR,它可在同一个PCR程序中实现两个温度段的探索工作,即横向的12个梯度和纵向的8个梯度。在实际应用中,一次实验即可获得96个温度组合,横向最优温度及纵向最优温度的交点即为最佳。如下图第F行和第6列的交点即为反应的最适温度。
  

 

横向温度梯度及纵向温度梯度同时进行探索


在实际操作中,只需对变性、退火、延伸温度中的两段分别设置即可。如:

纵向变性温度梯度:92.0, 92.5, 93.2, 94.4, 95.6, 96.8, 97.5, 98.0

横向退火温度梯度: 45.0, 45.6, 47.0, 49.0, 51.6, 54.0, 56.0, 58.4, 61.0, 63.0, 64.4, 65.0


RePure-C变性及退火温度梯度同时设置示例



相比于普通梯度PCR,二维梯度PCR具有如下优势:
时间:优化变性、退火、延伸温度中的两者可同时进行,节约了时间。如传统梯度PCR探索96个温度组合需要8次实验,二维梯度PCR只需1次即可,时间比例为8:1。
精准度:一次可获得96个温度组合,可筛选出最好的PCR条件进行实验,兼顾PCR产物的产量及质量(特异性)。
成功率:一次可获得96个温度组合,可提升复杂PCR实验的成功率,如模板GC含量高、成分复杂、目的片段丰度低等情况。
探索性:对于非PCR实验而言,可满足同时探索两个步骤温度梯度的需求,如CRISPR基因编辑、DNA自组装实验等。


RePure-C变性及退火温度同时优化示例(96个温度组合)


除了二维梯度功能之外,RePure-C还具备了8℃/s的最大升降温速率、自适应压杆式热盖、10.1 英寸电容屏显示及无线操控等特性,满足了用户多元化的需求,在分子生物学研究、试剂研发、法医测序等领域有着良好的应用前景。



 一台电脑手机操控多台PCR